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Avec la B6 Bi-Turbo Coupé, Alpina a également présenté une série spéciale de sa B3 célébrant son titre en Adac GT (avec la B6 GT3). Logiquement dénommé B3 GT3, cette série limitée à 99 exemplaires embarque quelques améliorations par rapport à la B3 S Bi-Turbo.